菌种是益生菌企业生产的核心，中微益生菌研究院于2014年成立，由疫苗开发、微生物研究、免疫学研究、生物研发制品四个团 队组成，组内成员均来自985、211等高校，拥有十多年的开发经验。

所有的菌种都由研究院的博士们亲自采集、培育，有的菌种来自人迹罕至的西藏高原生态，有的菌种来自内蒙乌兰察布四子王旗传统的奶酪，也有的来自四川古镇泡菜中，这些来自全国各地的菌种汇聚在研究院的菌种库中，在零下80℃的冰箱中超低温冷冻储存，目前已超过10万余株。